小兒肺炎易於下述疾病相混淆：
支氣管炎全身症狀較輕，一般無呼吸困難及缺氧症狀，肺部可聞及幹羅音及中粗溼羅音，不固定，常隨咳嗽或體位的改變而消失。
急性粟粒型肺結核
患兒發病急驟者常伴有高熱、寒戰，全身不適、氣促、發紺等全身中毒症狀，酷似支氣管炎，但肺部往往無明顯體徵，或有細溼羅音，散佈於兩肺，多在吸氣末發現。X線表現也與支氣管肺炎有相似之處。根據結核接觸史，臨牀症狀、結核菌素試驗陽性、血沉增快、痰或洗胃液檢到結核菌及X線的追蹤觀察的特點即可鑑別。
乾酪性肺炎
病變大多在虛弱或抵抗力低下的患兒中產生，X線顯示在一個肺段以至一葉肺的大部顯示緻密的實變，輪廓較模糊，通常可見到較爲透亮的液化區域，甚至透光的空洞。結合病史、結核菌素試驗等，易與支氣管肺炎鑑別。
支氣管異物
有異物吸入史，或有嗆咳史。臨牀輕、重不一，病程長短不等。病程遷延有繼發感染者可反覆發燒、咳嗽、肺部可聞及溼羅音與肺炎相似，有時聽診聞及氣管拍擊音可有助於診斷，但確診靠纖維支氣客鏡檢。
毛細支氣管炎
與急性肺炎很相似，但該病以喘憋爲主。兩肺可聞廣泛的哮鳴音及細溼羅音。重病患兒缺氧明顯，X線僅顯示兩肺透光度增強，膈肌下降，呈一過性肺氣腫改變，少數病兒有少許斑點狀陰影。
小兒肺炎與小兒感冒的鑑別
小兒肺炎起病急、病情重、進展快，是威脅小兒健康甚至生命的疾病。有時小兒肺炎又與小兒感冒的症狀相似，容易混淆。因此，家長有必要掌握這兩種小兒常見病的鑑別知識，以便及時發現小兒肺炎，及早醫治。鑑別它們並不太難，可從“一看、二聽、三摸”入手。一看：主要看四個方面看咳嗽時呼吸是否困難。感冒引起的咳嗽一般較輕，痰少，不會引起呼吸困難。小兒肺炎大多有咳嗽、有痰、氣喘、氣促，且程度較重，常引起呼吸困難。呼吸困難表現爲憋氣，兩側鼻翼一張一張的，口脣發紫，提示病情嚴重，切不可拖延。看精神狀態。小兒感冒時，一般精神狀態較好，能玩。小兒患肺炎時，精神狀態不佳，常煩躁、哭鬧不安，或昏睡、抽風等。看飲食。小兒感冒，飲食尚正常，或吃東西、吃奶減少。但患肺炎時，飲食顯著下降，不吃東西，不吃奶，常因憋氣而哭鬧不安。看睡眠。小兒感冒時，睡眠尚正常，但患肺炎後，多睡易醒，愛哭鬧；夜裏有呼吸困難加重的趨勢。二聽：聽肺部是否有水泡音由於小兒的胸壁薄，有時不用聽診器用耳朵聽也能聽到水泡音，所以家長可以在孩子安靜或睡着時在孩子的脊柱兩側胸壁仔細傾聽。肺炎患兒在吸氣末期會聽到“咕嚕”、“咕嚕”般的聲音，稱之爲細小水泡音，這是肺部發炎的重要體徵。小兒感冒一般不會有此種聲音。三摸：感覺胸部痰液的震動小兒痰多時，有時把手放在前胸或背部，可以感覺痰隨呼吸運動而震動。這是肺炎痰多的表現。而小兒感冒一般不會有明顯的痰震。
