秋季，晝夜溫差大，自上午10時到夜間時，氣溫仍然較高，食品上的病菌仍然可以大量生長繁殖，併產毒；而9月至11月又是秋扁豆中毒高發季節，因此，家長要注意孩子的飲食衛生，避免食物中毒及腸道傳染病的發生，腸道傳染病包括急性細菌性疾病、腸傷寒及各種腸炎、腹瀉症，甲型肝炎等。預防這類疾病應儘量減少在外就餐，出現症狀要及時就醫，注意隔離消毒。
秋冬季也是流感、風疹、腮腺炎、麻疹等呼吸道傳染病的高發季節，據本市防疫部門介紹：將安排小學二年級、中學一年級、高三在9月、12月份接種麻腮風三聯疫苗，10月至11月份接種流感疫苗。
此外，學校要把食品衛生和艾滋病防治知識納入學生健康教育的重要內容，教會學生掌握自我保護的本領。目前，我國艾滋病流行進入快速增長期，全國艾滋病感染者超過60萬，並正以每年10萬人的速度遞增，疫情涉及全國31個省、自治區和直轄市。去年，曾發生過兩起本市中學生在洗浴中心接受色情服務事件，說明中學生缺少對艾滋病和性傳播疾病的預防知識和防範能力。各學校要通過健康教育課，讓學生們瞭解艾滋病和性傳播疾病的危害及預防方法。
