《靈樞·四時氣》記載：“邪在膽，逆在胃，膽液泄則口苦，胃氣逆則嘔苦，故曰嘔膽。”說明古代醫家對此病有一定了解。胃食管反流病的病變主要在胃及食管，但也涉及肝膽脾。肝膽屬木，主疏泄，脾胃屬土，主升降，人的消化功能離不開脾胃肝膽。“脾宜升則健，胃宜降則和”，升降相因，則氣化氤氳，生化氣血津液，灌輸臟腑經絡，四肢百骸。木能疏土，膽汁之降泄，有助於脾胃的消化、運輸。在現代醫學中，肝臟是人體最大的消化腺，具有分泌膽汁，儲存糖原及解毒等重要生理功能。在病理情況下，肝氣旺則木橫逆克土，肝氣虛則木不疏土而壅滯，肝血虛則脾胃失養，肝火盛者灼爍胃陰；邪侵膽則逆在胃，令胃氣上逆，膽熱則液泄，使人口苦嘔逆，膽氣虛則膽失疏泄致膽胃不和；脾失健運則胃氣呆滯，脾不升清則胃不熟谷，脾陰不足則胃陰亦虧，胃氣壅滯土壅而木鬱，胃失和降則濁陰留滯，如此等等，演繹出種種病證。
根據臨牀觀察，胃食管反流病主要病機總由氣機升降失常，具體病機可概括爲：膽胃不和，肝胃不和，肝鬱脾虛，脾胃虛弱，氣滯血瘀五個方面。
