一般說來，在妊娠的前3個月中用藥易致畸形，因這時受精卵正處在相繼分化和聯合階段，各系統尚未完全形成，易受藥物的影響。妊娠4個月以上胎兒各器官已形成，藥物已不再有致畸作用。除反應停外，下述藥物有或可能有致畸作用，所以在頭3個月中應禁用或小心使用。
（1）抗腫瘤藥如氨甲喋啶易引起流產和無腦、腦積水、齶裂等畸形，與它種抗癌藥合用危險性更大。還有馬利蘭、苯丁酸氮芥、6一巰基嘌呤、環磷酰胺、去乙酰甲基水仙鹼、癌寧、長春鹼、烏拉坦及碘治療或骨盆放射，都可引起胎兒畸形。
（2）激素類於妊娠頭3個月應用可使女性胎兒男性化;3個月後應用，可使女性胎兒生殖器暫時增大等。
（3）抗糖尿病藥。有報道甲磺丁脲和氯磺丙脲引起死胎、新生兒死亡、多發性畸形和兔脣。有人認爲胰島素也能引起畸形。（4）抗瘧藥乙胺嘧啶和氯奎可致胎兒耳聾、腦積水和四肢缺陷畸形;長期大量使用奎寧可造成死胎、先天性耳聾，是否造成畸形尚有分歧。
（5）抗驚、鎮靜安定藥，如苯妥因鈉、去氧苯巴比妥、苯巴比妥都能引起胎兒兔脣和齶裂;氯丙嗪可引起視網膜病變;氟哌啶醇可引起四肢畸形，眠爾通、安定、利眠寧也可致畸胎。
（6）抗抑鬱藥丙咪嗪可引起胎兒骨畸形和兔脣;苯丙胺可致心臟缺損、大血管異位及畸形足等。
（7）抗凝血藥雙香豆素和華法令致胎兒出血、死亡或鼻骨發育不全。
（8）四環素可引起手指畸形、先天性白內障、骨生長障礙、牙釉發育不全及囪隆起或死胎。此外，經動物試驗藥物致畸的還有鏈黴素、利福平、乙硫異煙胺、TMP、磺胺類藥、安眠酮、乙醇、滅滴靈、安其敏、大劑量阿斯匹林、避孕藥、甲狀腺素、維生素A、菸鹼和偶氮染料及味精等。
