毒品的抑制食慾作用不僅可引起身體消瘦，還可引起某些人體必需的維生素和礦物質缺乏，從而引起一系列營養不良綜合徵。維生素B族缺乏會損傷中樞神經系統引起記憶力、注意力、學習能力顯著下降，甚至引起意識障礙。維生素B族缺乏還會引起末梢神經炎和各種皮炎。鐵元素缺乏可引起缺鐵性貧血，故而吸毒者中缺鐵性貧血非常常見。
吸毒常引起胃腸蠕動減慢進而引起便祕。這種便祕非常頑固，成爲長期令吸毒者苦惱的痼疾。有時吸毒者每隔一週或十餘天才大便一次，排便時出血非常常見。胃腸蠕動減慢還可引起腸梗阻。某些人爲了將毒品偷偷帶進醫院、教堂等治療地，利用身體藏匿毒品，吞服裝有毒品的避孕套，也會引起腸梗阻。此外，吸毒者的這種行爲也常引起意外中毒死亡。
阿片類毒品成癮者在突然停用毒品後會出現胃腸道蠕動異常加快，表現爲嚴重腹痛和腹瀉。腹瀉嚴重者可出現脫水現象。
可卡因對全身血管均有強烈收縮作用，對腸道血管的持續高度收縮可引起腸缺血和壞死。治療需手術切除。
肝炎在吸毒者中廣泛流行，甚至國外有人提出：“只要是確定的吸毒者，就一定合併有肝炎”。有研究證實對69名吸毒者在封閉條件下進行半年的觀察，發現有52人至少有一項或更多的肝功能化驗結果異常。一般認爲，乙型肝炎是由於共用被污染的注射器所傳染。海洛因易引起慢性肝功能損害，可能與海洛因對肝臟的直接毒性作用有關。
