1.右腎絞痛
始發於右腰或腹部，可向右股內側或外生殖器放射，伴肉眼或鏡下血尿，無發熱，腹軟，無腹膜刺激徵，右腎區叩擊痛或臍旁輸尿管行程壓痛。腹部乎片多可顯示腎、輸尿管結石。
2.壺腹癌或胰頭癌
伴有黃疸者密作鑑別，該病起病緩慢，黃疸呈進行性加重；可無腹痛或腹痛較輕，或僅有上腹不適，一般不作寒戰高熱，體檢時腔軟，無腹膜刺激徵，肝大，常可肋及腫大膽囊；晚期有腔水或惡病質表現。ERCP或MBCP和CT檢查有助於診斷。
3.急性闌尾炎
腹痛伴有發熱時，要與急性闌尾炎進行鑑別。有些闌尾炎爲高位闌尾炎，症狀體徵與急性膽囊炎非常類似，容易混淆。但是急性闌尾炎時膽囊無增大，膽囊壁正常，可資鑑別。
4.急性胰腺炎
急性胰腺炎與急性膽囊炎較難鑑別，尤其是發病初期。都可以有上腹痛及壓痛，急性膽囊炎是也可有血尿澱粉酶增高。但是急性胰腺炎腹痛多在上腹部或左上腹部，程度更爲劇烈，澱粉酶升高更爲明顯。B超、CT等影像學檢查如果發現胰腺瀰漫性增大，周邊有滲出，則多提示是急性胰腺炎。急性胰腺炎也可與急性膽囊炎共存，如果是膽總管患者發生急性腹痛，又有膽囊增大和胰腺增多，則往往提示急性膽囊炎和急性胰腺炎共存，多爲結石性膽囊炎和膽源性胰腺炎。
5.心絞痛、心肌梗死
如果患者出現腹痛，尤其是老年人，一定要與心絞痛、心肌梗死進行鑑別。有些心絞痛、心肌梗死常表現爲上腹痛疼痛，但病人常有心絞痛病史，有瀕死感、大汗、疼痛、無力、疼痛向左肩部放射等，心電圖會顯示Q波和損傷性ST改變，心肌酶會有異常發現。
6.膽道蛔蟲病
發病突然，腹痛在劍突下呈陣發性絞痛，嘔吐頻繁，常有吐蛔蟲史，腹痛可自行緩解。早期上腹部壓痛不明顯，無腹肌緊張。
7.潰瘍病穿孔
病人多有胃、十二指腸潰瘍史，腹痛發作突然，呈持續性，較急性膽囊炎劇烈，並很快波及整個腹部，腹肌強直，但很少有嘔吐現象。因較小的十二指腸穿孔，或穿孔後很快形成一個侷限的炎性病竈時，容易與急性膽囊炎混淆。
