引起腸梗阻的原因可分爲機械性和非機械性兩大類。易於理解，機械性腸梗阻是指腸道被阻塞，其原因可由於腸管本身病變、腸管外壓迫和腸管內異物阻塞3種情況。細分起來，腸管本身病變可以是先天性的(如閉鎖、狹窄、發育不全)、炎症性(如克羅恩氏病、細菌性和放射性小腸炎)、腫瘤(原發或轉移、惡性或良性)、腸套疊等;腸管外壓迫可以是疝(內、外疝)、粘連、先天性條索、扭轉、腫塊壓迫(如腫瘤、膿腫、血腫、變異血管);腸內異物阻塞可以是食入異物、膽石、糞石或糞便、鋇劑、寄生蟲。非機械性腸梗阻一類是神經肌肉紊亂，包括麻痹性腸梗阻、腸段神經節缺如(如巨結腸症);另一類是血管閉塞如動脈或靜脈。
有趣的是不同的國家和地區及不同年代，不同原因引起的腸梗阻的發生率有差別。總的趨向是嵌頓性外疝引起的相對下降，而繼發於腹內粘連則相對上升。
