出現睾丸疼痛，診斷睾丸扭轉的話，需要與以下幾種疾病進行鑑別：
1.嵌頓疝 病人既往有腹股溝斜疝的病史。腹股溝斜疝嵌頓時，陰囊部可有劇烈的疼痛，並伴有明顯的壓痛。腹部也有壓痛，且伴有噁心嘔吐、停止肛門排便及排氣等症狀。聽診可聞及腸鳴音亢進、有氣過水聲。睾丸及附睾檢查無異常。
2.急性睾丸炎及附睾炎 可有睾丸疼痛等症狀，伴發熱、白細胞增高。多見於成人，發病較慢，疼痛症狀較輕
3.輸尿管結石 表現爲突發性腰腹部絞痛，並可放射至股部、會陰部、陰囊，伴噁心、嘔吐，但陰囊及其內容物均正常。
4.睾丸附件扭轉 睾丸附件扭轉的臨牀症狀與睾丸扭轉相似，也可發生噁心、嘔吐、腹部不適的症狀。發病一般較緩和，在一兩天內逐漸加重，但也有疼痛劇烈、急性發作的。體格檢查可在睾丸的上極觸及腫塊。臥牀休息、應用非激素類抗炎藥物、托起陰囊可使症狀得到緩解。
5.陰囊血腫：這類病人主要有明顯的外傷史。
6.鞘膜積液：這是一種慢性發展的疾病，一般情況下不會很痛。
7.睾丸附睾扭轉：這類疾病一般是青年人多發。
如果患者出現睾丸腫脹，不發燒，醫生就會懷疑可能是睾丸扭轉，要立即進行探查手術。
還應與精索靜脈曲張、特發性陰囊水腫、脂肪壞死、病毒感染相鑑別。
