小陰莖一般是指到成年後陰莖還像孩童一樣，不能充分勃起，睾丸發育不良。形成小陰莖的原因，有些是先天性的，主要與妊娠後第6~9個月期間雄性激素分泌不足有關；有些是由於疾病引起的，如下丘腦或垂體的異常、睾丸異常、染色體異常等。由於陰莖是男性顯露於體表的外生殖器，因此，古今中外關於陰莖大小與功能的謬傳甚多。
許多荒誕不經的言談，深植於某些人的性意識之中，形成了各種各樣的誤解。也正因爲這樣，許多青少年男性在青春發育期中，對自己的陰莖大小非常關注。他們不僅注意自己的，也偷偷觀看別人的陰莖，並私下進行比較。一旦發現自己的陰莖比別人小，就會疑慮重重，總認爲自己的小陰莖會影響將來的婚姻質量與生育能力，甚至因此而產生“自慚形穢”的自卑心理。
陰莖短小與遺傳、肥胖等有一定關係，還有一些人是後天外傷等原因造成的。先天性陰莖短小一般都可以藉助手術來改善。這個手術其實並不複雜，只要切斷部分牽制陰莖深淺的韌帶，將原先隱匿在體內的一段海綿體拉出來一點，同時把陰囊再向移就可以了，創傷小、沒有痛苦、時間短、恢復快，效果顯著。
其實，真正的小陰莖極少。小陰莖一般是指到成年後陰莖還像孩童一樣，不能充分勃起，睾丸發育不良。形成小陰莖的原因，有些是先天性的，主要與妊娠後第6~9個月期間雄性激素分泌不足有關；有些是由於疾病引起的，如下丘腦或垂體的異常、睾丸異常、染色體異常等。我國學者曾調查了1000例正常男子常態下陰莖的長度和周長，其結果是“陰莖在非勃起狀態下的長度爲4.5~8.6釐米，平均爲6.55釐米；最長1例爲19.6釐米，最短的爲3.7釐米。直徑爲2.06~3.08釐米，平均爲2.57釐米。周長7.02～9.42釐米，平均爲8.22釐米；陰莖冠部爲7.11~9.83釐米，平均爲8.5釐米。同時也檢測了身高，結果證明，男子身高與陰莖長度之間並無明顯的比例關係。這一調查結果表明：①小陰莖是極少的， 即使常態下長3.7釐米的陰莖，也在正常之列；②民間傳說的高大男子陰莖必長、矮小男子陰莖必短的說法是毫無科學根據的。事實上，許多關心自己陰莖大小的男性，其陰莖在生理結構上都是正常的。某些人由於肥胖或陰囊腫脹，陰莖可能顯得較小，但這只是一種錯覺，並非是真正的小陰莖；某些人的“小陰莖”則可能是由於自己自上而下地觀察自己陰莖的結果，倘若也像觀察別人那樣對着鏡子觀察一番自己的陰莖，就會發現自己的陰莖變“大”了。這是由於視角不同而引起的視錯覺而已。
對於真正的小陰莖患者要儘量瞭解清楚其發病原因才能對症治療。睾丸本身有問題的患者，因其根本問題在於雄激素不足，可長期使用雄激素作爲替代治療。用藥後多可發現第二性徵改善，陰毛、鬍鬚均增多，但生育力不能改善。停藥後可能有反覆。睾酮用藥時間越早越好，一旦確診後，就應開始治療。但診斷時必須首先排除其他病變，特別是青春期延緩，後者不需治療。兒童期過多使用睾酮可使骨骼融合過早，影響身體發育、長高。原因不明的小陰莖也可試用睾酮治療。成年男子不要濫用睾酮，最好請專科醫生制訂治療計劃。
