乙肝疫苗的不良反應，主要是噁心、皮疹、頭痛、發熱、不適、疲勞、流感樣症狀、嘔吐、頭暈、蕁麻疹、瘙癢、關節痛、肌痛、腹瀉和嗜眠等，發生率爲１∶５５５００～１∶２９４０００。
極個別接種者有視力減退、嗜酸粒細胞增多、腎小球性腎炎或血小板減少性紫癜等。這些症狀和疾病與重組疫苗的關係雖尚未完全確定，但應引起重視。從２０多個國家研究資料綜合分析，重組乙肝疫苗的安全、有效已肯定，除注射局部有輕度疼痛、紅腫、硬結，偶有發熱、疲勞、頭痛外，未見有直接相關的嚴重不良反應。
臨牀研究表明，人體對基因工程乙肝疫苗（酵母重組）有很好的耐受性，無嚴重副反應出現。有報道極少數對酵母或硫柳汞高敏者，在接種後有致敏現象，這種人羣應禁用。
小編語：對於已患乙肝或乙肝病毒攜帶者來說，注射乙肝疫苗已經失去了意義．
