1.手術切除：可行全切或次全切，但腫瘤與頸內動脈、視神經等周圍組織緊密相連且大的瘤體對周圍組織的侵潤，其效果往往不能令人滿意，複發率高，且易產生下丘腦損傷引起尿崩症，體溫失調，無菌性腦膜炎。手術後症狀改善亦不理想。
2. 頭部伽瑪刀治療：伽瑪刀治療顱咽管瘤目前技術很成熟，因爲伽瑪刀治療的精確性，所以很少能傷害到腫瘤周邊的正常組織。對於有囊性變的腫瘤，可以在伽瑪刀治療後對囊液進行穿刺。
3.中醫治療：抗瘤正腦系列的配伍應用，適用於未行手術或手術部分切除，術後復發，X-刀、γ-刀，放化療後患者用藥3個月左右可消除症狀，使瘤體縮小或消失，手術用藥可消除殘瘤，預防復發，臨牀應用多年來療效確切。
