腦血栓也叫做腦栓塞，腦血栓是指因異常的固態、液態、氣態物體（被稱作栓子）沿血循環進入腦動脈系統，引起動脈管腔閉塞，導致該動脈供血區局部腦組織的壞死。然而這麼淺顯的腦血栓問題還是很大的，只有知道了腦血栓的病因才能更好地診斷和治療。
1.心源性
最常見，佔腦血栓的60%～75%。腦血栓通常是心臟病的重要表現之一。最多見的直接原因是慢性心房纖顫；在青年人中，風溼性心臟瘤仍是併發腦血栓的重要原因；感染性心內膜炎時瓣膜上的炎性贅生物脫落。心肌梗死或心肌病的附壁血栓、二尖瓣脫垂、心臟黏液瘤和心臟外科手術的併發證等亦常引起。先天性心臟病房窒間隔缺損者，來自靜脈系統的栓子亦可引起反常栓塞。
2.非心源性
主動脈弓及其發出的大血管的動脈粥樣硬化斑塊和附着物脫落，引起的血栓栓塞現象也是引起短暫性腦缺血發作和腦梗死的較常見的原因。其他較少見的還可有：肺靜脈血栓或血凝塊、肺部感染、敗血症可引起腦血栓，長骨骨折或手術時脂肪槍和氣栓，血管內診斷治療時的血凝塊或血栓脫落，癌性栓子，寄生蟲蟲卵栓子，異物栓子。腎病綜合徵高凝狀態亦可發生腦血栓。
3.來源不明
約30%腦血栓不能確定原因。
