一、治療方法的選擇
（一）男女兩性在外生殖器部位所見到的疣體，如果單個疣體直徑《5mm、疣體團塊直徑《10mm、疣體數目《15個，則外用藥物治療。
（二）男性尿道內和肛周，女性的前庭、尿道口、陰道壁和子宮頸口的疣體，或男女兩性的疣體大小和數量均超過上述標準者，建議用物理方法治療。
（三）物理療法治療後，體表尚有少量疣體殘存時，可再用外用藥物治療。
（四）無論藥物治療或物理治療，必需作醋酸白試驗，儘量清除疣體損害，以減少復發。
二、外用藥物
（一）0.5%鬼臼毒素酊 是首選的藥物。方法是將藥液塗於疣體上，每天用藥2次，連續3天爲一個療程。如果疣體沒有脫落，則在休息4天后作第二療程治療，可連續用藥三個療程。不良反應主要是局部疼痛，紅腫，沒有發現全身性不良反應。孕婦禁用。
（二）10%～25%足葉草酯酊 由於毒性較大，已逐漸被其提純產物0.5%鬼臼毒素酊所代替。每週一次，每次用藥藥量不應超過0.5ml，1～4小時後將藥液洗去；用藥6次未愈應改用其它療法。孕婦禁用。
（三）三氯乙酸溶液 濃度從30%～80%不等，這是一個化學腐蝕劑，應由有經驗的醫護人員使用，不宜交患者本人使用。每日一次，將藥液直接塗於皮損上，用藥6次未愈應改用其它療法。
（四）2.5%～5%氟尿嘧啶軟膏 主要作用爲干擾並抑制RNA的合成。外用每天1～2次，至疣體脫落，若周圍正常皮膚黏膜出現紅腫、糜爛，則應暫停使用。
（五）5%咪喹莫特（imiquimod）乳膏 咪喹莫特屬於非核苷類異環胺類藥物，外用可通過誘導機體產生干擾素（IFN）、腫瘤壞死因子（TNF）和白介素（IL）等細胞因子，發揮免疫調節作用，主要用於治療HPV感染引起的外生殖器和肛周尖銳溼疣。本品一般在日常入睡前使用，隔日1次，療程可達16周。咪喹莫特並不會破壞皮膚組織，但在外用部位可引起紅斑、糜爛、水腫、剝脫、鱗屑和瘙癢、灼熱感等輕、中度的刺激。
（六）干擾素 部外用干擾素通過刺激T細胞及對病毒的抑制作用而起到治療效果，對小的尖銳溼疣有一定效果。外用的優點是藥物無刺激性，局部不會出現紅腫、疼痛等不良反應。缺點是起效較慢，需連續外用4～6周。亦可局部注射，但疼痛較著且需多次治療，不易爲患者所接受。局在尖銳溼疣以較爲快捷的方法治療後，可外塗干擾素軟膏，一則對亞臨牀感染的損害起治療作用，二則可起預防復發的作用。
二、物理療法
（一）液氮冷凍 用棉籤浸蘸液氮後，稍加壓放置於皮損上數秒鐘，如此反覆多次。每週1次，一般需數次治療。不良反應有局部水腫，可持續數天。
（二）二氧化碳激光 適於疣體較小的病例。在女性宮頸口、男性尿道口的尖銳溼疣難以外用藥，可採用二氧化碳激光治療。
（三）光動力學治療（PDT） 方法是將新鮮配製的20%ALA溶液持續外敷於患處3小時，然後用150mJ/cm2的氦-氖激光連續照射20～30分鐘。間隔1～2周治療一次，一般1～3次可治癒。治療尿道口尖銳溼疣獲得98%以上的治癒率，而且複發率很低。
（四）電灼 適於有蒂、大的尖銳溼疣。當尖銳溼疣呈菜花或疣贅狀生長時，基底常形成蒂，此時先以電灼法在蒂部作切割是理想的治療手段，剩餘的損害可採用冷凍、激光或藥物等治療。
（五）手術 適於大的尖銳溼疣。以手術方法將疣的主體切除，等傷口癒合後採用局部藥物或冷凍等手法。有的患者包皮過長，建議作包皮環切術。
三、系統治療
（一）干擾素 100萬U至300萬U皮下或肌肉注射，隔日或每週注射2次。有一定效果。免疫功能低下的尖銳溼疣患者可以選用。
（二）左旋咪唑 鑑於部分尖銳溼疣患者的細胞免疫功能低下，故而採用本藥，有口服及外用二種。口服每天3次，每次50mg，服用3天，停11天爲一療程，可連續服用數個療程。外用系將左旋咪唑溶液塗於左前臀屈側。
（三）其他免疫調節劑 如轉移因子等。
