輕微的胃腸炎患者一般5-7天不經治療也可自行痊癒。但如果連帶有腹痛、糞便帶血、發熱或其他症狀，或持續時間較長，應及時去看醫生。
病毒性的急性胃腸炎沒有特效藥，但是它本是有一個自限的過程，一般情況下腹瀉三五天后不服用藥物自身就會好，但是關鍵是腹瀉的嚴重程度問題，腹瀉嚴重會出現脫水、電解質紊亂甚至休克等症狀。因此這時候就要就醫，進行輸液或者口服補液。
細菌性的急性胃腸炎用一些一般的抗生素就行，比如氟鈦酸、黃連素、諾氟沙星等都很好。一般服用就會好。
