夜磨牙的原因比較複雜，其原因大致有以下幾個方面：
1、睡覺姿勢不好有關
兒童睡覺時經常頭偏向一側，易造成咀嚼肌不協調，使受壓的一側咀嚼肌發生異常收縮，因而發生磨牙。
2、寄生蟲感染有關
寄生在膽道和腸道的寄生蟲所產生的一些毒素，可直接刺激膽道和腸道，也會引起咀嚼肌反射性收縮，導致磨牙。
3、精神因素有關
如白天過於緊張、激動或興奮，使大腦皮質過度疲勞，入睡後就會通過神經反射的作用引起咀嚼肌收縮而出現磨牙現象。情緒緊張，如考試期間的學生、月經前的婦女、精神緊張的工作人員中常有夜磨牙現象的發生。有的人用磨牙、咬牙等方式來表達壓抑、發怒等感情，如這種狀態延續時間較長或成爲一種習慣，在大腦皮質相應部位就會產生一個異常興奮區。晚上睡眠時，該興奮區如仍很活躍，就會出現夜磨牙。由此可見，夜磨牙的發生與腦的功能狀態有着密切的關係。
4、咬合系統不正常有關
咬合障礙是夜磨牙發生最重要的原因。咬合障礙破壞了咀嚼器官的協調關係，於是，機體以增加牙齒的磨動來去除咬合障礙，這是機體整體協調一致的表現。正如鼻腔不通暢的人，夜問睡覺時便會用嘴呼吸一樣，是機體的一種代償反應。
5、牙齒排列不整齊有關
有後牙反頜、多生牙佔位等牙齒排列不整齊的兒童，其咀嚼肌的位置也往往不正常，這樣在夜間睡眠時，咀嚼肌常常會發生無意識的收縮，從而引起磨牙。
